肥尾守宫虽然和豹纹守宫十分相似，但仔细观察，还是略有不同的，那么如何分辨肥尾守宫的公母，其实和豹纹守宫也是基本一样的，如果你可以分辨豹纹守宫，同样可以分辨肥尾守宫。
首先，鉴别守宫需要个体年龄达到3个月以上的压成或者成体方可鉴别，3个月以下小个体需要一定经验且容易出错。
方法一：将守宫尾巴提起，使其后腿腾空，雄性个体可以看到肛门下方在尾巴的基部有两个明显的凸状物，而雌性个体则没有或不明显。此方法对于未成年的亚成个体效果不是很好，仅推荐作为成体性别鉴别使用。
1.V沟：位于肛门上方腹部下方，由一个个股孔组成，类似于一个倒过来的“V”字。雌雄个体都有V沟，雄性个体较明显，雌性个体不明显，一些雌性亚成体甚至看不到V沟
2.鞭毛：由股孔分泌出的蜡状物质。鞭毛只有雄性个体会有，而雌性个体没有，也正是因为有鞭毛所以雄性个体V沟才会明显于雌性个体。需要说明的是鞭毛比不是说真的有毛，只是雄性个体股孔较大，稍微偏焦黄色 ，而雌性个体的股孔只有一个小灰点，使得V沟看起来很不明显。
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